Trước đây, Bản Ngò là một xã thuộc huyện Hoàng Su Phì.

Ngày 15 tháng 12 năm 1962, Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định 211/1962/QĐ-CP[1] về việc chia xã Cốc Pài thành xã Cốc Pài (nay là thị trấn Cốc Pài) và xã Bản Ngò.

Ngày 1 tháng 4 năm 1965, Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định số 49-CP[4] về việc thành lập huyện Xín Mần trên cơ sở tách xã Bản Ngò thuộc huyện Hoàng Su Phì.